課堂 | 連續(xù)斷層 3D 重構中的超薄切片制備，ARTOS 3D

當需要以納米級分辨率觀察樣品超微結構時，科學家通常借助電子顯微鏡（觀察表面結構的掃描電鏡 SEM 和觀察內部結構的透射電鏡 TEM）——它們是當前科研界可使用的大顯微成像工具。

電鏡成像要求對樣品進行通常 20-150 nm的超薄切片，使用超薄切片機切割的切片厚度薄、表面平整、光滑且無人為干擾因素，因此可以滿足電鏡成像對制備樣品的嚴苛要求。如果大量超薄切片具有樣品結構的前后連續(xù)性，SEM 成像采集的圖像就可以進行樣品內部結構的 3D 重建，形成可用于分析的完整超微、精細立體圖像，即連續(xù)斷層成像技術（Array Tomography, AT）。

今天，小編簡要介紹一下 AT 成功的關鍵環(huán)節(jié)：連續(xù)超薄切片樣品制備。

111超薄切片之重要性111

AT 常用于細胞、蛋白質等生物 / 生物大分子結構的納米分辨率、3D 結構觀察和分析，主要步驟為包埋樣品連續(xù)（超?。┣衅?、TEM / SEM 或光學顯微鏡對其進行成像、對獲得的一系列圖像進行重建分析。AT 可以獲得的有效信息包括超微結構的定量、體積分析和細胞 / 蛋白的形態(tài)學數據等，相較于共聚焦顯微鏡獲得的圖像，具有更高的水平和空間分辨率（可達 0.2 nm）。

超薄切片主要用于 TEM 成像前的樣品制備，以納米分辨率觀察樣品內部結構信息。無污染且獲取快速的超薄切片的主要優(yōu)勢在于：

• 整個切片均可用于電鏡成像，適合大尺寸樣品分析；

• 單張切片電子透射均一性好，保證結果可靠性；

• 制備速度快，短時間即可獲得大量切片；

• 適用樣品范圍廣，生物樣本和工業(yè)材料均適用。

11超薄切片的基本原理11

對于 TEM 或者 3D 結構重建，樣品高質量連續(xù)切片是前提。因此，一臺如 Leica EM UC7 或者 EM ARTOS 3D（20-50 nm）（見圖 1）一樣穩(wěn)定可靠的超薄切片機是開展實驗的*工具。

▲圖 1. Leica 連續(xù)超薄切片機新品 —— EM ARTOS 3D

樣品被安裝在可上下前后移動的電動機械臂上，機械臂垂直上下移動、遇到固定的玻璃刀或鉆石刀時，這條樣品帶被切下（圖 2），然后刀臺自動向左移動，按照設定的切片厚度完成第二條切割。同理，隨后刀臺再向左移動，完成第三條切割（圖 3）。從刀片上直接取下切片是十分困難的，因為它非常薄且脆弱，徠卡超薄切片機采用溫和水流托舉的方式使條帶不斷分離，能夠保證條帶質量不被破壞同時操作極其簡單（冷凍切片情況可借助顯微操作），然后進行上電鏡前的其它必要處理。

▲ 圖 2. EM ARTOS 3D 超薄切片機樣品切割位置基本結構

▲ 圖 3. EM ARTOS 3D 制備的連續(xù)超薄切片條帶

連續(xù)斷層成像的樣品制備

多數未處理的生物樣品比較柔軟，AT 成像前的樣品制備主要包括下面幾個步驟：

• 組織固定

• 樣品水分抽提和包埋

• 連續(xù)切片和切片條帶收集

• 切片染色以用于成像（如果需要）

后使用 SEM 或光學顯微鏡（通常熒光成像情況）對結構上具有連續(xù)性的切片進行成像，合成圖像以進行 3D 重建和分析。

對于市面上多數超薄切片機，使用者在 AT 成像的樣品制備時，通常會發(fā)現這是一項耗時耗力、中間一些操作必須手工完成的工作。EM ARTOS 3D 是 Leica 2019 年新推出的 3D 連續(xù)超薄切片機，能夠自動化連續(xù)切片、顯著縮短樣品制備時間、減少人工操作、切片無褶皺、厚度均一、溫和水流取條帶、提高樣品制備成功率等眾多優(yōu)點，在向下兼容普通超薄切片需要的同時，特別合適高通量切片和 AT 等前沿研究對樣品制備的嚴苛要求 

1111111數據展示1111111

▲ 圖 4. AT 技術獲得的鼠淋巴結 3D 結構重建